Ο Αντώνης Νικοπολίδης αντιμετώπισε τον Άρη ως παίκτης του Ολυμπιακού στο πρωτάθλημα 10 φορές και οι 6 εξ αυτών ήταν στο γήπεδο των Θεσσαλονικέων, «Κλεάνθης Βικελίδης».
Από το 2004 έως και το 2010, κατάφερε να γευθεί τη χαρά της νίκης με τους «ερυθρόλευκους» δύο φορές, σε τρεις αναμετρήσεις έφυγε ηττημένος ενώ το Σεπτέμβριο του 2007 οι δύο ομάδες έμειναν στην ισοπαλία του 1-1.
Ο διεθνής Ηπειρώτης τερματοφύλακας κατόρθωσε αρκετές φορές με τις επεμβάσεις του, να εξελιχθεί σε πρωταγωνιστή των συγκεκριμένων αναμετρήσεων, βοηθώντας την ομάδα του να εκπληρώσει το στόχο της.
Την τελευταία φορά που επισκέφτηκε το σπίτι του Άρη, ο Νικοπολίδης άφησε το στίγμα του, αφού στις 28 Μαρτίου 2010, αρνήθηκε το γκολ στον Σέρχιο Κόκε στη «μάχη των 11 μέτρων», με τον γκολκίπερ του Ολυμπιακού να μπλοκάρει την μπάλα μετά την εκτέλεση πέναλτι του Ισπανού αρχηγού των γηπεδούχων.