Ο Αντώνης Νικοπολίδης έχει γράψει τη δική του ιστορία στα ντέρμπι των “αιωνίων¨ αντιπάλων, αγωνιζόμενος και με την πράσινη και με την κόκκινη φανέλα.
Μάλιστα, ο κορυφαίος Έλληνας τερματοφύλακας, πέραν των εξαιρετικών αποκρούσεων που διαμόρφωσαν αποτελέσματα, έχει πιάσει πέναλτι σε ντέρμπι και για τις δύο ομάδες, το 2001 και το 2008, με εκτελεστές τους Πρέντραγκ Τζόρτζεβιτς και Δημήτρη Παπαδόπουλο.
Ο Νικοπολίδης στις 4 Μαρτίου του 2001, σε αναμέτρηση στο Ολυμπιακό Στάδιο απομάκρυνε ως πορτιέρε του Παναθηναϊκού τη μπάλα σε εκτέλεση πέναλτι του σπεσιαλίστα Πρένρτραγκ Τζόρτζεβιτς, κρατώντας το μηδέν για την ομάδα του (το ματς στο σημείο της επέμβασης ήταν στο 0-0).
Και στις 13 Ιανουαρίου 2008, σε μια ακόμη σπουδαία αναμέτρηση ¨αιωνίων¨αντιπάλων στο γήπεδο Καραϊσκάκης ως τερματοφύλακας του Ολυμπιακού πια, ο Αντώνης Νικοπολίδης έπιασε πέναλτι του Δημήτρη Παπαδόπουλου με το σκορ στο 1-1.
Ο διεθνής τερματοφύλακας μπλόκαρε μάλιστα τη μπάλα και το αποτέλεσμα της αναμέτρησης δεν άλλαξε μέχρι το φινάλε.