Ο Μάρκο Σκέποβιτς γεννήθηκε στις 23 Μαίου του 1991 στο Βελιγράδι. Ταραγμένη περίοδος για την πρώην ενωμένη Γιουγκοσλαβία και ο πατέρας του Μάρκο, Σλάνταν αποφάσισε να αφήσει τη χώρα του. Ο επίσης ποδοσφαιριστής Σλάνταν Σκέποβιτς αγωνίστηκε απ’ το 1992 ως το 1996 στον Απόλλωνα Λεμεσού με μεγάλη επιτυχία, ενώ ολοκλήρωσε την καριέρα του το 1997 στην ισπανική Μερίδα.
Κάπως έτσι ο νεαρός Μάρκο διαμόρφωσε τις πρώτες ποδοσφαιρικές παραστάσεις πριν ξεκινήσει να κλοτσάει το τόπι για πρώτη φορά, όπως και ο πατέρας του, στην Παρτιζάν το 2002. Απ’ τις ακαδημίες της Παρτιζάν ο Μάρκο Σκέποβις μεταπήδησε το 2008 στην Τελεόπτικ, υπογράφοντας το πρώτο του επαγγελματικό συμβόλαιο. Ύστερα από δύο χρόνια στην Τελεόπτικ επέστρεψε στο ποδοσφαιρικό του σπίτι, την Παρτιζάν.
Ένα βαρύ φορ ύψους 190 εκατοστών με καλή τεχνική και επαφή με τα δίκτυα. Οι άνθρωποι της Παρτιζάν τον θεωρούν ένα απ’ τα σπουδαιότερα σύγχρονα ταλέντα της χώρας, όμως κάποιοι τραυματισμοί φρέναραν την ραγδαία εξέλιξη της καριέρας του. Παρ’ όλα αυτά ο υψηλόσωμος φορ κατάφερε να πατήσει και πάλι στα πόδια του για να γίνει μάλιστα ένας απ’ τους αρχηγούς της Παρτιζάν.
Την τελευταία τριετία αγωνίστηκε σε 66 αγώνες σε όλες τις διοργανώσεις πετυχαίνοντας 22 γκολ. Ο νεαρός άσος δεν ξεπροβοδίστηκε ωστόσο με τον καλύτερο τρόπο απ’ τους φανατικούς της Παρτιζάν. Μετά το τέλος της εντός έδρας αναμέτρησης για τον τρίτο προκριματικό γύρο του Champions League, στον οποίο η ομάδα του γνώρισε τον αποκλεισμό απ’ τη Λουντογκόρετς, ένας απ’ τους αρχηγούς της εξέδρας των φανατικών μπήκε στον αγωνιστικό χώρο και επιχείρησε να αφαιρέσει το περιβραχιόνιο του αρχηγού απ’ τον Σκέποβιτς. Όλα αυτά στις 6 Αυγούστου. Ένα μήνα περίπου αργότερα ο 22χρονος Μάρκο έφτασε στην Ελλάδα για να υπογράψει το νέο του συμβόλαιο με τον Ολυμπιακό.