8η Σεπτεμβρίου 2015, σημαδιακή μέρα για το αγγλικό ποδόσφαιρο καθώς ο Γουέιν Ρούνει έσπασε το ρεκόρ του Μπόμπι Τσάρλτον και έφτασε τα 50 γκολ με την Εθνική. Η Αγγλία αντιμετώπιζε την Ελβετία για τα προκριματικά του ευρωπαϊκού πρωταθλήματος του 2016 στο στάδιο Γουέμπλεϊ. Ο Ρούνεϊ συμπλήρωνε εκείνο το βράδυ 107 συμμετοχές με τα ”Τρία Λιοντάρια”, πιάνοντας τον Άσλεϊ Κόουλ στην 5η θέση όλων των εποχών, ενώ παράλληλα σημείωσε και το 300ο του γκολ σε όλες τις διοργανώσεις, σε συλλογικό και εθνικό επίπεδο.
Το ρολόι έγραφε 84ο λεπτό, ο επιθετικός της Μάντσεστερ Γιουνάιτεντ έστησε την μπάλα απέναντι από τον Ελβετό Γιαν Ζόμερ, η μπάλα κατέληξε στα δίχτυα, η Αγγλία νίκησε 2-0 και προκρίθηκε αργότερα στο Euro.
Ο Ρούνεϊ φόρεσε για πρώτη φορά την φανέλα της Εθνικής Αγγλίας το χειμώνα του 2003 σε μια αναμέτρηση απέναντι στην Αυστραλία στο Boleyn Ground σε ηλικία 17 ετών και 111 ημερών υπό τις οδηγίες του Σβεν Γκόραν Έρικσον. Πέτυχε το παρθενικό του γκολ με το εθνόσημο αργότερα εκείνη τη χρονιά, στην 6η του συμμετοχή απέναντι στα Σκόπια και έγινε ο νεότερος παίκτης σε ηλικία 17 ετών και 317 ημερών, σπάζοντας το ρεκόρ του Μάικλ Όουεν που είχε σκοράρει κόντρα στο Μαρόκο το 1998, ενώ παράλληλα έγινε και ο νεότερος παίκτης στην ιστορία που πετυχαίνει γκολ σε αγώνα προκριματικών.Ο Ρούνει ποτέ στην καριέρα του στην Εθνική δεν πέτυχε χατ τρικ. Πέτυχε από δέκα φορές δύο γκολ σε ένα ματς, ενώ αγαπημένη του ομάδα ήταν το αδύναμο Σαν Μαρίνο με πέντε γκολ. Τον Σεπτέμβριο του 2014, μετά την αποχώρηση του Στίβεν Τζέραρντ, φόρεσε το περιβραχιόνιο και στο πρώτο του ματς ως αρχηγός σκόραρε με πέναλτι κόντρα στη Νορβηγία (1-0, φιλικό).
Αποσύρθηκε από την Εθνική το 2018 παίζοντας για τελευταία φορά ως αλλαγή σε φιλικό αγώνα απέναντι στις ΗΠΑ (3-0). Κρέμασε την φανέλα της Εθνικής βάζοντας 53 γκολ σε 120 συμμετοχές διατηρώντας μέχρι και σήμερα τον τίτλο του πρώτου σκόρερ όλων των εποχών.
Προκριματικά EURO: 16 γκολ
Φιλικοί αγώνες: 16 γκολ
EURO: 6 γκολ
Προκριματικά Παγκοσμίου Κυπέλλου: 16 γκολ
Παγκόσμιο Κύπελλο: 1 γκολ
1ο γκολ: 6 Σεπτεμβρίου 2003, Αγγλία – Σκόπια 2-1 (προκριματικά EURO 2004)
50ο γκολ: 8 Σεπτεμβρίου 2015, Αγγλία – Ελβετία 2-0 (προκριματικά EURO 2016)
53ο και τελευταίο γκολ (πέναλτι): 27 Ιουνίου 2016, Αγγλία – Ισλανδία 1-2 Euro 2016