Ο Γιάν Κόλερ έβαλε τέλος στην καριέρα του σε ηλικία 38 ετών, για λόγους υγείας, όπως μετέδωσε την Τετάρτη το εθνικό πρακτορείο ειδήσεων της Τσεχίας (CTK). Ο πανύψηλος (2,02 μέτρα) στράικερ είναι αυτή τη στιγμή ο πρώτος σκόρερ στην εθνική Τσεχίας με 55 τέρματα σε 91 εμφανίσεις. Στη διάρκεια της καριέρας του αγωνίστηκε, μεταξύ άλλων, στην Τσεχία με τη Σπάρτα Πράγας, στην Γερμανία με τις Ντόρτμουντ και Νυρεμβέργη, στο Βέλγιο με τις Λόκερεν και Άντερλεχτ, στη Γαλλία με τη Μονακό, καθώς και στη Ρωσία με τη Σαμάρα.
Έφτασε με την εθνική Τσεχίας στους ημιτελικούς του EURO 2004, ενώ στέφθηκε πρωταθλητής στην πατρίδα του με τη Σπάρτα, στη Γερμανία με την Ντόρτμουντ και στο Βέλγιο με την Άντερλεχτ. Τον Ιανουάριο του 2010 επέλεξε να αγωνιστεί στην Γ΄ κατηγορία της Γαλλίας με τις Κάννες.