Η παρουσία του Παναθηναϊκού σε διάφορα αθλήματα είναι αρκετά έντονη, ωστόσο λίγοι γνωρίζουν ή θυμούνται ότι οι Πράσινοι είχαν – και μάλιστα σε δύο χρονικές περιόδους – και ομάδα χάντμπολ!
Μάλιστα ο Παναθηναϊκός ήταν ένας από τους… πρωτεργάτες στο διάστημα “εκκίνησης” του χάντμπολ στη χώρα μας και συμμετείχε στην πρώτη διοργάνωση που έγινε στην Αθήνα το 1930!
Η συγκεκριμένη ομάδα ιδρύθηκε το 1929 και αγωνίζονταν κυρίως παίκτες της ποδοσφαιρικής ομάδας του Παναθηναϊκού, ενώ συμμετείχε στις τοπικές διοργανώσεις μέχρι και το 1935 όταν και ανέστειλε τη λειτουργία του.
Η δεύτερη εποχή του Παναθηναϊκού στο χώρο του χάντμπολ ήταν τη δεκαετία του 1980. Με πρωτοβουλία του πρωταθλητή του στίβου, Ζήση Κουρελού, οι Πράσινοι επανίδρυσαν το τμήμα και συμμετείχαν τη σεζόν 1980-81 στον πρώτο όμιλο της προκριματικής φάσης του Πανελλήνιου πρωταθλήματος.
Το τριφύλλι είχε ανδρικό και γυναικείο τμήμα στο χάντμπολ και το 1990 διέκοψε τις δραστηριότητες του εξαιτίας οικονομικών προβλημάτων.